En infektion er en tilstand, der indtræder, når en mikroorganisme trænger ind i en værtsorganisme og der udøver sin antigene og eventuelt skadelige effekt.
Først når en mikrooraganisme i trængt igennem en overflade (hud, slimhinde) og ind i vævet, er der tale om infektion. At have bakterier i urinen er altså ikke en infektion.
At udøve sin antigene effekt vil sige, at det specifikke infektionsforsvar (immunsystemet) aktiveres og kodes til at uddanne T-lymfocytter, og til at udvikle antistof rettet mod netop denne mikroorganisme.
Eventuelt skadelige betyder, at infektionen ikke nødvendigvis giver symptomer. Man taler om ”stumme infektioner” eller ”subkliniske infektioner".