Bakteriekapsel er en slimet substans, som dækker bakteriernes overflade og beskytter dem mod at blive fagocytteret.
Det er en rigtig god beskyttelse mod det indre infektionsforsvar, neutrofile granulocytter og makrofager kan ikke fagocyttere dem, og makrofager kan ikke præsentere deres antigener for det specifikke infektionsforsvar. Dvs. det uspecifikke cellulære forsvar kan ikke stille noget op, og det specifikke forsvar kan slet ikke aktiveres.
Til hjælp i forsvaret mod kapseldannende bakterier, producerer milten tuftsin, som klistrer til kapslen og gør den ”ru”, så bakterien kan fagocytteres. I princippet kan alle bakterier få genet for kapseldannelse, men nogle har det næsten altid f.eks. pneumokokker.